برنامه سازه های هیدرولیکی در سال 1982 تاسیس شد و دومین برنامه تحصیلات تکمیلی در گروه است که بر روی تجزیه و تحلیل و طراحی سازه های در تماس با آب از جمله سدها، سرریزها، آبریزها، ناودانها، حوضچه های آرامش و سازه های دریایی تمرکز دارد. این برنامه شامل دوره ها و پروژه هایی در زمینه سازه ها، هیدرولیک و مناطق ژئوتکنیک است. همچنین دانشجویان علاقه مند را برای یک دوره دکترا آماده می کند.